蛋白质是临床诊断、疾病分型、药物筛选等领域广泛的检测对象。经典酶联免疫吸附实验(ELISA)技术的灵敏度一般只能达到pg/mL水平,对于超低丰度蛋白的检测往往力不从心。例如:NfL、Aβ40/42等神经相关因子虽然在脑脊液中的含量较高,一旦到了外周血中其丰度会成百倍降低。又例如,IL-1β、IL-17A等重要的炎症因子,在疾病初期和健康人群表达量非常低,往往只有fg级别。常规的ELISA,甚至包括以增强信号强度为出发点开发的电化学发光技术(如MSD)和以降低背景信号为出发点开发的毛细管电泳技术(如Ella和Erenna)等高灵敏蛋白质检测技术,也受到其检测下限的限制,难以获得这些蛋白准确的检测数值。
Simoa(Single-molecule Array)单分子超灵敏蛋白质检测技术的出现,将蛋白质检测技术直接带入到单分子、数字化检测时代,灵敏度比ELISA提高1000倍以上,成为fg级超低丰度蛋白质检测领域的优势技术。
Simoa超灵敏蛋白质检测技术原理
Simoa检测的生物学原理仍然是经典的免疫反应-双抗夹心法,所不同的是,Simoa技术将约250,000个捕获抗体包被在2.7 μm的小磁珠上,检测时加入生物素标记的检测抗体及亲和素偶联的酶和底物,通过一层油将单个磁珠分别封闭在238,000个4.5 μm的反应孔(Well)中进行反应。由于每个小孔的反应体系仅仅为50飞升,比传统ELISA小20亿倍,这时小孔中即使只有一个分子,其催化底物就可产生3000个荧光分子,通过CCD摄像头即可捕获到信号,利用泊松分布理论可计算出阳性荧光小孔(On Well)对应的蛋白浓度值,实现数字化单分子检测的愿望。
ELISA检测如同墨水滴入2000个鸟巢大小的泳池中,信号会无限地扩散和稀释,只有样品浓度达到一定阈值(比如pg/mL以上),才能被ELISA检测到,再根据所有信号的平均值来计算浓度。而Simoa的检测就好比将一滴墨水滴入矿泉水瓶中,很容易就被观察到。之后通过对238,000个孔中每一个阳性信号孔(On Well)的个数进行统计,而不需要通过信号强度的线性增加来获取对应浓度值,也就降低了低丰度信号定量检测的门槛,即为“数字化”检测原理在蛋白检测中的运用。
David Yeung [5]等研究人员对比了目前世界上现有的高敏蛋白质检测技术对于IL-2、IL-6、IL-17A、TNF-α等低丰度炎症因子的检测情况,发现Sioma技术无论在灵敏度还是在数据重现性上,相比其他技术均具有显著优势(见表1)。
Simoa超灵敏蛋白质检测技术优势
● Simoa可以在血清/血浆中检测NfL、Tau、pTau、Aβ40、Aβ42等超低丰度神经因子;
● Simoa可以通过加大稀释倍数,检测房水、玻璃体、眼泪等微量样品中的炎症因子;
● Simoa可以在单个细胞中定量蛋白,实现单个胚胎细胞培养上清中的蛋白检测;
● Simoa可以在外泌体等稀少样品类型中检测PD1、PD-L1蛋白;
● Simoa可以在阿尔兹海默症初期(提前16年),在接近正常人的患者血清中检测到蛋白标志物NfL[2]